Az Országos Kórházi Főigazgatóság (OKFŐ) közleménye szerint a Péterfy kórház orvosigazgatója által elrendelt belső vizsgálat megállapította, hogy a kórház belső szabályzata megszűnt intézeteket, intézményeket és jogviszonyokat tartalmaz. Hiányosnak ítélték meg a működési előírásokat is, amelyek többségükben hatálytalanok voltak.
Az elhunytakat egy kézzel vezetett, bizonytalan adatokat tartalmazó naplóban regisztrálták, amiben nem tüntették fel a holtestek beérkezésének és elszállításának dátumát.
A közlemény azt is kifejti, hogy a boncolások ütemezetlenül történtek, azok időpontjáról nem kaptak tájékoztatást az érintett fekvőbeteg osztályok. Ráadásul a boncterem tisztasága az egészségügyi követelményeknek nem felelt meg.
A belső vizsgálat azt is megállapította, hogy a kórház korábbi vezetése előtt a halottkezeléssel kapcsolatos problémák ismertek voltak, azonban nem tettek intézkedést azok kiküszöbölésére.
Augusztus végén derült ki, hogy a Péterfy Sándor Utcai Kórház-Rendelőintézet patológiai osztályán nem szerepelt a nyilvántartásban két halott, és méltatlan körülmények között tárolták őket. Az intézmény megbízott vezetője ezért megszüntette a boncmester és a boncsegéd munkaviszonyát, a Készenléti Rendőrség Nemzeti Nyomozó Irodája pedig eljárást indított.
A belső ellenőrzés kapcsán, melynek teljes dokumentációját továbbították a nyomozóknak, az is kiderült, hogy a két holttest mellett emberi szerveket is engedély nélkül tároltak az osztályon.